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RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究

點擊次數(shù):1043  更新時間:2023-10-24

在生命科學(xué)領(lǐng)域,RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)正逐漸成為研究細(xì)胞生命活動的重要工具。它可以幫助我們深入了解細(xì)胞在特定生理狀態(tài)下的基因表達(dá)模式,為疾病診斷、藥物研發(fā)和生物醫(yī)學(xué)研究提供有力支持。


一、RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究對象

RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究對象包括細(xì)胞類型、組織類型、生理狀態(tài)等。在細(xì)胞類型方面,RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以對各種人體細(xì)胞進(jìn)行深入研究,揭示不同細(xì)胞之間的基因表達(dá)差異。在組織類型方面,RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以分析不同組織中的基因表達(dá)譜,揭示組織特異性的基因表達(dá)模式。在生理狀態(tài)方面,RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以研究細(xì)胞在不同生理狀態(tài)下的基因表達(dá)變化,如生長、分化、凋亡等。


二、RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究方法

RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究方法主要包括高通量測序、表達(dá)譜分析、生物信息學(xué)處理等。高通量測序技術(shù)可以快速、準(zhǔn)確地測定基因組的全部轉(zhuǎn)錄本,從而獲得全面的基因表達(dá)信息。表達(dá)譜分析則可以對大量基因進(jìn)行同時檢測,揭示基因表達(dá)的差異和協(xié)同性。生物信息學(xué)處理則可以對測序數(shù)據(jù)進(jìn)行深入挖掘,解析出基因表達(dá)的復(fù)雜模式。


三、RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究應(yīng)用

RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究應(yīng)用廣泛,包括功能研究、疾病診斷、藥敏測試等。在功能研究方面,RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以幫助我們深入了解基因的功能和作用機制。在疾病診斷方面,RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以識別與疾病相關(guān)的關(guān)鍵基因,為疾病的早期診斷和預(yù)后預(yù)測提供依據(jù)。在藥敏測試方面,RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以預(yù)測藥物對細(xì)胞的效應(yīng),為新藥研發(fā)和個性化治療提供支持。


四、RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究對象主要是轉(zhuǎn)錄組,即細(xì)胞內(nèi)所有基因及其表達(dá)產(chǎn)物的信使RNA(mRNA)和非編碼RNA等。

  1. mRNA:mRNA是基因表達(dá)過程中的關(guān)鍵分子,它攜帶了從DNA轉(zhuǎn)錄而來的信息,并進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)中進(jìn)行翻譯,生成具有特定功能的蛋白質(zhì)。RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以通過對mRNA的研究,揭示基因的表達(dá)水平和轉(zhuǎn)錄本,從而深入探究生物過程和疾病機理。

  2. 非編碼RNA:除了mRNA,RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)還研究非編碼RNA,如微RNA(miRNA)和長非編碼RNA(lncRNA)等。這些非編碼RNA在基因表達(dá)調(diào)控中發(fā)揮重要作用,可以影響基因轉(zhuǎn)錄、翻譯和蛋白質(zhì)功能等。通過對非編碼RNA的研究,可以進(jìn)一步揭示基因表達(dá)的復(fù)雜性和調(diào)控機制。


五、重要研究工具

       PAXgene血液RNA管用于立即穩(wěn)定細(xì)胞內(nèi)RNA,從而產(chǎn)生準(zhǔn)確且可重復(fù)的基因表達(dá)數(shù)據(jù)。PAXgene血液RNA管含有一種專有試劑,可在采集后立即穩(wěn)定細(xì)胞內(nèi)RNA。細(xì)胞內(nèi)RNA在室溫下穩(wěn)定長達(dá)三天或在2-8°C下穩(wěn)定長達(dá)五天。PAXgene試管可以在-20°C至-70°C的溫度下冷凍,以便長期儲存。

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PAXgene血液RNA管特點:

◆ 體外診斷使用,具有CE-IVD標(biāo)志,符合歐盟98/79/EC 指令

◆ 整合的系統(tǒng),用于采集、穩(wěn)定和純化胞內(nèi)RNA

◆ 提供在分析工作進(jìn)行之前的樣本標(biāo)準(zhǔn)化處理

◆ 在 18~25℃下,RNA穩(wěn)定可長達(dá)3天

◆ 在-20℃ 或 -70℃條件下至少穩(wěn)定50個月



參考文獻(xiàn)

  1. Friedman, N. et al. (2009). The landscape of the regulatory elements identified by integration of ENCODE with the Catalogue of Somatic Mutations in Cancer (COSMIC). Genome Res 19, 92-104.

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